檔案整理是檔案管理活動(dòng)的核心，是提高檔案管理質(zhì)量和其他環(huán)節效率的前提。正確理解檔案整理理論是做好檔案整理工作的基礎。然而，檔案整理理論并不是一個(gè)永恒的科學(xué)規則，它伴隨著(zhù)人類(lèi)社會(huì )實(shí)踐的發(fā)展而發(fā)展，直接影響著(zhù)檔案整理實(shí)踐的發(fā)展。因此，我們對檔案整理理論的理解應該是一個(gè)不斷發(fā)展的過(guò)程。

　　以文件雙重物質(zhì)結構為邏輯起點(diǎn)，可認識現代文件整理的本質(zhì)：確保文件歷史聯(lián)系與社會(huì )實(shí)踐的對稱(chēng)關(guān)系。從邏輯上講，只有當文件整理獲得的歷史聯(lián)系具有與社會(huì )實(shí)踐相同的結構時(shí)，才能大限度地保持文件之間的歷史關(guān)系。而且傳統檔案與現代檔案整理的本質(zhì)區別在于：它們所形成的歷史聯(lián)系到底應該與誰(shuí)“對稱(chēng)”。如果其歷史聯(lián)系與文件實(shí)體排序有對稱(chēng)關(guān)系，那么形成的檔案排序必須是傳統檔案排序或原始檔案排序;如果與社會(huì )實(shí)踐的關(guān)系是對稱(chēng)的，這個(gè)檔案的排序一定是現代檔案的排序。從現代檔案整理結構來(lái)看，檔案之間的歷史聯(lián)系來(lái)自于社會(huì )實(shí)踐。檔案整理的過(guò)程是根據社會(huì )實(shí)踐的真實(shí)情況對檔案進(jìn)行排序，實(shí)現檔案與社會(huì )實(shí)踐的對應，進(jìn)而實(shí)現檔案記錄歷史原貌的功能。文件是利用實(shí)體及其歷史聯(lián)系記錄歷史的結果。因此，檔案整理的本質(zhì)是：保持檔案歷史聯(lián)系與社會(huì )實(shí)踐的對稱(chēng)關(guān)系。